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生化特征的检测方法
访问量:566 发表于 2010-06-21 08:53:55
 

 

根据调亡的生化特征的检测方法

一、琼脂糖凝胶电泳

1)常规的琼脂糖凝胶电泳

方法一:

1.收集细胞(5×1061000r/min,离心5min,去上清。

2.PBS洗一次,1000r/min,离心5min,去上清。

3.加细胞核裂解液500μl重悬细胞,50℃水浴,35h,不时振摇或37℃过夜。

4.0.5ml平衡酚抽提,上下颠倒几次混匀,6000r/min,离心5min

5.上清移至另一Ep管,加0.5ml氯仿:异戊醇抽提,上下颠倒几次混匀,6000r/min,离心5min

6.上清移至另一Ep管,加50μl3mol/L乙酸钠和2ml预冷无水乙醇,上下颠倒几次混匀,可见絮状白色沉淀物。

7.置液氮510min12 000r/min离心10min沉淀DNA,去上清,真空抽干或风扇下吹干残存液体。

8.50100μl TE缓冲液,另加5μl RNase37℃水浴30min

9.20μl加上样缓冲液25μl1%琼脂糖凝胶电泳(电压50V1.52h),UV下观察。

 

方法二:

1.离心收集细胞(5×106),PBS(无Ca2Mg2)洗12次。

2.0.5ml TBE溶液重悬,37℃孵育30min

3.1mg/ml蛋白酶K 37℃处理30min

4.加入上样缓冲液0.1ml

5.25μl上样,1.5%的琼脂糖凝胶上电泳,2V/cm 6h

 

方法三:

1.收集细胞悬液(106细胞),低速离心(1000r/min,离心5min)。

2.去上清,沉淀加0.4ml低渗缓冲液作用1h

3.13 000r/min,离心10min,将上清转移至另一Eppendorf管中,加等量50%异丙醇和0.5mol/L NaCl混匀,置液氮5min

4.12 000r/min,离心10min,弃上清,沉淀真空抽干。

5.TE 100μl65℃加热10min,取20μl,加12μl上样缓冲液,电泳观察。

 

方法四:

1.收集细胞,1000r/min离心5min,去上清。

2.用冰预冷的70%乙醇固定,可长期保存于-20℃冰箱。

3.1000r/min离心5min,去除固定液,用约0.5mlPBS重悬细胞。

4.转入Eppendorf管中,同法离心,去上清。

5.细胞用40μl PC缓冲液重悬,室温3060min

6.1000r/min离心5min,吸上清于新的Eppendorf管中,真空浓缩15min

7.加入0.25 NP-40溶液3μl1mg/ml RNase A溶液3μl37℃,30min

8.加入3μl蛋白酶K37℃,30min

9.加入12μl样品稀释液,含溴化乙锭的1.5%琼脂糖电泳,观察。

 

2)琼脂糖凝胶电泳的定量检测

简易末端标记法

1.按常规提取细胞DNA

2.0.5mlEP管中加入细胞DNA,反应体系如下:细胞DNA 0.51.0μg10×缓冲液2μl32P-dATP(或-dCTP0.5μCiKlenow聚合酶5U,双蒸水加至20μl

3.混匀后稍加离心,室温反应30min

4.1μl 0.5mol EDTA终止反应。

5.常规酚/氯仿/异戊醇抽提1次,无水乙醇沉淀DNA,真空抽干。

6.溶于20μlTE缓冲液中。

7.取标记DNA1.8%琼脂糖凝胶上点样,50V电泳约2h

8.电泳后的凝集置滤纸上烘干,进行放射自显影。

 

5’末端32P标记法

细胞DNA的提取

1.细胞悬液离心后,沉淀加消化缓冲液0.5ml50 35h,或37℃过夜。

2.用等体积的酚:氯仿:异戊醇抽提细胞裂解液。

3.将水相转移至新的试管,加入150mmol/L乙酸钠和10mmol/L氯化镁。

4.加入2倍体积的预冷无水乙醇,置液氮5min或-20 12h

5.12 000r/min离心沉淀DNA70%乙醇洗1次后,真空抽干。

6.溶于20μlTE缓冲液中。

7.加入终浓度为10μg/ml RNase37℃,30min

8.同法用等体积酚:氯仿:异戊醇抽提,乙醇沉淀,真空抽干。

9.溶液20μlTE缓冲液中,-20保存备用。DNA含量测定:用260nm波长紫外分光光度计:吸光单位为20时约为1mg/ml DNA

 

DNA 5’末端脱磷酸

1.取纯化的细胞DNA 10μg,然后加入:10×CIP 2μl1U),双蒸水加至50μl

2.37℃水浴2h

3.90℃水浴5min以灭活CIP

4.用等体积酚:氯仿:异戊醇抽提,乙醇沉淀,真空抽干。

 

DNA 5’末端32P标记

1.将脱磷酸样品DNA置冰浴上,再加双蒸水10μl10×缓冲液2μlT4多核苷酸激酶10U32P-ATP 740kBq20μCi),双蒸水加至20μl

2.混合后,37℃水浴60min

3.加入1μl0.5mol/L EDTA90℃灭活5min

 

观测

1.取一定量的标记DNA稀释后在1.8%琼脂糖凝胶上点样,50V电泳约2h

2.电泳后的凝胶置滤纸上烘干,进行放射自显影。

3.32P标记DNA电泳干凝胶进行同位素液闪测定,计算放射活性。

二、原位末端标记技术

 1DNA聚合酶或Klenow大片段介导的原位缺口平移(ISNT

1.切片常规脱蜡,梯度乙醇复水化。

2.将切片组织浸入2×SSC液中,80℃,20min,然后蒸馏水冲尽。

3.0.5%胃蛋白酶(pH2.037℃消化020minPBS洗尽。

4.用滤纸擦干组织块周边液体放入湿盒组织切片上滴加缓冲液A5min。缓冲液A50mmol/L Tris-HCl, 5mmol/L MgCl2, 10mmol/L β-巯基乙醇,0.005BSApH7.5

5.弃去缓冲液A,滴加标记液约50μl25℃温育1h。标记反应液:0.005mmol/L dNTP, 0.005mol/L biotin-16-dUTP, 25U/ml Klenow大片段。

6.PBS漂洗2次,各3min

7.内源酶阻断剂阻断15min

8.PBS2次,各3min

9.滴加HRP-avidin覆盖组织,室温下30min

10.  PBS2次,各3min

11.  DAB-H2O2显色约5min

12.  流水冲洗后,苏木素复染1min。常规脱水,透明,封片。

13.  阴性对照片在第5步改加不含Klenow的标记液,余同。

 

2TdT介导的dUTP缺口末端标记技术(TUNEL

1.切片常规脱蜡,复水,后续过程在湿盒内进行。

2.3%的H2O2阻断内源性辣根过氧化物酶30min

3.0.15mol/LPBS2次,每次5min

4.切片浸泡在2×SSC 80 20min

5.0.15mol/LPBS2次,每次5min

6.蛋白酶K或胃蛋白酶消化020min

7.0.15mol/LPBS2次,每次5min

8.TdT缓冲液孵育10min

9.TdT反应液37℃孵育1h

10.  切片浸泡在2×SSC溶液10min,以终止反应。

11.  0.15mol/LPBS2次,每次5min

12.  链卵白素标记的辣根过氧化物酶孵育30min

13.  0.15mol/LPBS2次,每次5min

14.  0.04%的DAB显色510min,镜下控制时间。

15.  苏木素复染35min,常规复水,透明和封片。

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