反向柱所用流动相一般含有缓冲盐，用水冲洗是为了充分冲洗掉流动相中含有的缓冲盐，避免缓冲盐沉淀于柱子中，从而影响柱子的性能、寿命。为了保持柱子良好的柱效，提高柱子的使用寿命，用水冲洗应该是必要的。
用纯水冲洗还要看你柱子的性能，一般的柱子是不可以用纯水的，至少5%的有机相冲洗